但他与父亲分开居住了，这种情况可以再申请宅

家中只有一个儿子且已分居，通常不能再申请宅基地。根据《土地管理法》相关规定，宅基地分配以一户一宅为原则，若仅一个子女且已分居，不符合再申请条件。不及时处理可能导致违法占用土地，面临法律处罚。
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不能再申请宅基地。若家中只有一个儿子且分居，可考虑：1.在原宅基地上改建或扩建，满足居住需求；2.若条件允许，通过购买、租赁等方式解决居住问题；3.咨询当地政府部门，了解是否有特殊政策或帮扶措施。需遵守法律法规，避免违法占地。
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此情况一般无法再申请宅基地，常见处理是考虑其他居住方案。若确需改善居住条件，可选择在原有宅基地上扩建或改造，或考虑购买商品房等其他合法途径，具体需根据实际情况和法律规定选择。